*本系统功能模块、字段参数,均可结合用户实际业务需求调整,可增可减,以达到最佳业务管理流程的体验!
编号 | 模块名称 | 字段参数 |
1 | 数据导入 | 文件名、基因序列、基因注释、参考基因组、检测工具、测序平台、等位基因频率等 |
2 | 数据预处理 | 序列修剪、质量过滤、碱基配对、退火模拟、密码进化、核酸配对位点等 |
3 | 基因组比对 | 对齐算法、搜素算法、比对质量、对齐长度、参考基因组版本、比对位点等 |
4 | 基因注释 | 功能注释、通路注释、变异注释、GO注释、KEGG注释、变异类型等 |
5 | 具体基因分析 | 多态性分析、基因结构分析、基因家族分析、保守区分析、变异效应预测、基因差异表达等 |
6 | 基因组可视化 | 基因序列显示、基因结构图、染色体图、突变图谱、SNP图谱、染色体位置等 |
7 | 基因表达 | 表达量分析、表达差异分析、RNA:seq分析、差异表达基因、统计学方法、表达矩阵等 |
8 | 转录因子 | 结合位点预测、共同作用蛋白预测、转录因子调控网路、DNA结合结构、转录因子家族、转录因子表达等 |
9 | 基因组变异 | SNP分析、INDEL分析、CNV分析、SV分析、位点数目、位点类型等 |
10 | 染色体组装 | 多序列对比、染色体拼接、汇聚物组装、超长读取长度、染色体断点、拼接序列保守性等 |