*本系统功能模块、字段参数,均可结合用户实际业务需求调整,可增可减,以达到最佳业务管理流程的体验!
编号 | 模块名称 | 字段参数 |
1 | 品种信息管理 | 品种ID、品种名称、遗传背景、基因型、外表型、种质资源ID、所属群体、地理位置、采集日期、保存单位等 |
2 | 基因组数据导入 | 样本ID、样本类型、采集日期、采集地点、库类型、DNA提取方法、富集方法、测序平台、测序策略、数据质量评估等 |
3 | 基因序列比对 | 比对算法、比对参数、参考基因组ID、比对结果、序列质量分数、比对率、异常插入/缺失、SNP位点等 |
4 | 基因注释 | 注释源、基因名称、基因功能、进化关系、相对表达水平、翻译序列、基因本体术语、信号肽、结构域、可变区等 |
5 | 基因表达模式分析 | 组织/器官名称、表达水平、差异表达基因、表达热图、表达趋势、基因调控网络、共表达基因集、通路分析结果、转录因子互作网络等 |
6 | 遗传多样性分析 | SNP位点、等位基因频率、杂合度、遗传距离、群体结构、种群遗传结构、等位基因多样性、合并群体索引、中性演化等 |
7 | 基因组重组率分析 | 遗传标记、重组频率、连锁图、连锁相位、重组热点、重组贡献率、基因组范围、位点关联性、遗传地图、连锁不平衡等 |
8 | 进化潮流分析 | 进化树构建算法、进化树分支长度、进化分支时间轴、进化树展示、进化树节点支持度、物种分类信息、基因家族进化、进化速率、PAML分析结果、基因家族扩张/收缩等 |
9 | 基因功能预测 | 蛋白结构预测算法、功能域预测、跨膜区域预测、亚细胞定位预测、酶家族预测、功能保守性分析、碱基间相互作用模拟、与人类基因组同源性、功能注释等 |
10 | 基因组编辑 | 编辑工具、编辑目标、突变类型、编辑效率、替代效率、离靶效应、编辑结果确认、效应预测、编辑定位位点、异常基因型检测等 |